首页期刊介绍编委会电子期刊广告合作联系我们下载专区论文重合率查重留言板投稿须知

《右江医学》关于“新型冠状病毒肺炎”论文的征稿启事 《中国期刊网》《中国学术期刊(光盘版)全文收录》《中国学术期刊综合评价数据库》来源期刊 “万方数据-数字化期刊群”全文上网《中国核心期刊(遴选数据库)收录》《中文科技期刊数据库》来源期刊《龙源期刊网》合作期刊    友情提醒:我刊未委托任何单位、网站或个人代理征稿,以免上当受骗。

 

 

位置:首页 >> 电子期刊 >> 正文
基于GEO数据库基因表达数据探索影响卵巢癌患者预后及临床分期的基因
作者:侯娟 蒋树立 滕长财 
单位:滨州医学院附属医院检验科 
关键词:卵巢癌  临床分期  基因本体论  通路富集分析  预后  
分类号:R737.31;Q811.4
出版年,卷(期):页码:2022,50(3):176-180
摘要:
目的 利用基因表达综合征(gene expressed omnibus, GEO)公共数据库筛选与卵巢癌分期相关的基因,并分析其临床意义。方法 从GEO数据库的数据集GSE9891中筛选与临床分期相关差异基因,通过DAVID数据库对差异基因进行基因本体论(gene ontology, GO)和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析。并且通过肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)对差异基因进行验证。结果 分析数据集GSE9891得到23个与临床分期相关差异基因;GO富集分析发现有效靶基因参与胶原组织和细胞外基质合成;KEGG通路富集分析发现主要通过类固醇合成信号通路影响卵巢癌进展过程。临床分期相关差异基因在TCGA数据库中验证得到LUM、COL11A1、IGF1、TIMP3、COL10A1、FAP、COL8A1、EPYC、SFRP2、FABP4与临床分期相关(P<0.05,|log2FC|>1.5),其中COL8A1、COL11A1、COL10A1、FABP4和SFRP2等五个基因与卵巢癌的预后相关(P<0.05)。结论 COL8A1、COL11A1、COL10A1、FABP4和SFRP2可能是影响卵巢癌进展的生物标志物。
基金项目:
滨州医学院科技计划项目(BY2017KJ02);
作者简介:
参考文献:
服务与反馈:
文章下载】【加入收藏

 右江民族医学院附属医院《右江医学》编辑部版权所有 CopyRight:www.yjyx.org All Rights Reserved.
本网站所刊登的各种新闻﹑信息、材料和各种稿件,版权均归本编辑部所有,未经协议授权,禁止转载、禁止下载使用。
本网站由右江民族医学院附属医院《右江医学》编辑部及北京博思汇文数字科技有限公司共同维护
编辑部电话/传真:0776-2825575;网站技术支持电话: 010-60213898
地址:广西百色市右江区中山二路18号,邮编:533000
备案号:桂ICP备06012708号-3      公安局备案号:45100202000267号